Tree @upstream/2.2.3+ds (Download .tar.gz)

• ..
• ext
• tasks
• test_run_data
• tests
• __init__.py
• aln_to_metadata.py
• assembly.py
• assembly_compare.py
• assembly_variants.py
• bam_parse.py
• best_seq_chooser.py
• card_record.py
• cdhit.py
• cluster.py
• clusters.py
• common.py
• external_progs.py
• faidx.py
• flag.py
• histogram.py
• link.py
• mapping.py
• mash.py
• read_filter.py
• read_store.py
• ref_genes_getter.py
• ref_preparer.py
• refdata_query.py
• reference_data.py
• report.py
• report_filter.py
• samtools_variants.py
• scaffold_graph.py
• sequence_metadata.py
• sequence_variant.py
• summary.py
• summary_cluster.py
• summary_cluster_variant.py
• summary_sample.py
• versions.py
• vfdb_parser.py