Codebase list genometools / HEAD testdata / gt_eval_ltr_test_1.in
HEAD

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gt_eval_ltr_test_1.in @HEAD — raw · history · blame 

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seq12	LTRharvest	long_terminal_repeat	378284	378621	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon12
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seq12	LTRharvest	inverted_repeat	378284	378285	.	?	.	Parent=repeat_region12
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seq12	LTRharvest	target_site_duplication	378622	378626	.	?	.	Parent=repeat_region12
###
seq13	LTRharvest	repeat_region	96603	102526	.	?	.	ID=repeat_region13
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seq13	LTRharvest	inverted_repeat	102190	102191	.	?	.	Parent=repeat_region13
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###
seq13	LTRharvest	repeat_region	519156	525065	.	?	.	ID=repeat_region14
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###
seq13	LTRharvest	repeat_region	562026	567995	.	?	.	ID=repeat_region15
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###
seq14	LTRharvest	repeat_region	117697	123632	.	?	.	ID=repeat_region16
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seq14	LTRharvest	inverted_repeat	123290	123291	.	?	.	Parent=repeat_region16
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###
seq14	LTRharvest	repeat_region	594814	600737	.	?	.	ID=repeat_region17
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###
seq14	LTRharvest	repeat_region	704057	710027	.	?	.	ID=repeat_region18
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seq14	LTRharvest	inverted_repeat	709690	709691	.	?	.	Parent=repeat_region18
seq14	LTRharvest	inverted_repeat	710021	710022	.	?	.	Parent=repeat_region18
seq14	LTRharvest	target_site_duplication	710023	710027	.	?	.	Parent=repeat_region18
###
seq14	LTRharvest	repeat_region	970273	976241	.	?	.	ID=repeat_region19
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seq14	LTRharvest	LTR_retrotransposon	970278	976236	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon19;Parent=repeat_region19
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seq14	LTRharvest	inverted_repeat	975900	975901	.	?	.	Parent=repeat_region19
seq14	LTRharvest	inverted_repeat	976235	976236	.	?	.	Parent=repeat_region19
seq14	LTRharvest	target_site_duplication	976237	976241	.	?	.	Parent=repeat_region19
###
seq15	LTRharvest	repeat_region	56447	62380	.	?	.	ID=repeat_region20
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seq15	LTRharvest	inverted_repeat	62039	62040	.	?	.	Parent=repeat_region20
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seq15	LTRharvest	target_site_duplication	62376	62380	.	?	.	Parent=repeat_region20
###
seq15	LTRharvest	repeat_region	436880	443112	.	?	.	ID=repeat_region21
seq15	LTRharvest	target_site_duplication	436880	436884	.	?	.	Parent=repeat_region21
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seq15	LTRharvest	long_terminal_repeat	442737	443107	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon21
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seq15	LTRharvest	inverted_repeat	442737	442738	.	?	.	Parent=repeat_region21
seq15	LTRharvest	inverted_repeat	443106	443107	.	?	.	Parent=repeat_region21
seq15	LTRharvest	target_site_duplication	443108	443112	.	?	.	Parent=repeat_region21
###
seq15	LTRharvest	repeat_region	804635	810562	.	?	.	ID=repeat_region22
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seq15	LTRharvest	LTR_retrotransposon	804640	810557	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon22;Parent=repeat_region22
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seq15	LTRharvest	long_terminal_repeat	810224	810557	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon22
seq15	LTRharvest	inverted_repeat	804972	804973	.	?	.	Parent=repeat_region22
seq15	LTRharvest	inverted_repeat	810224	810225	.	?	.	Parent=repeat_region22
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seq15	LTRharvest	target_site_duplication	810558	810562	.	?	.	Parent=repeat_region22
###
seq15	LTRharvest	repeat_region	844402	850340	.	?	.	ID=repeat_region23
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seq15	LTRharvest	long_terminal_repeat	849998	850335	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon23
seq15	LTRharvest	inverted_repeat	844743	844744	.	?	.	Parent=repeat_region23
seq15	LTRharvest	inverted_repeat	849998	849999	.	?	.	Parent=repeat_region23
seq15	LTRharvest	inverted_repeat	850334	850335	.	?	.	Parent=repeat_region23
seq15	LTRharvest	target_site_duplication	850336	850340	.	?	.	Parent=repeat_region23
###
seq15	LTRharvest	repeat_region	850619	856554	.	?	.	ID=repeat_region24
seq15	LTRharvest	target_site_duplication	850619	850623	.	?	.	Parent=repeat_region24
seq15	LTRharvest	inverted_repeat	850624	850625	.	?	.	Parent=repeat_region24
seq15	LTRharvest	LTR_retrotransposon	850624	856549	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon24;Parent=repeat_region24
seq15	LTRharvest	long_terminal_repeat	850624	850961	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon24
seq15	LTRharvest	long_terminal_repeat	856212	856549	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon24
seq15	LTRharvest	inverted_repeat	850960	850961	.	?	.	Parent=repeat_region24
seq15	LTRharvest	inverted_repeat	856212	856213	.	?	.	Parent=repeat_region24
seq15	LTRharvest	inverted_repeat	856548	856549	.	?	.	Parent=repeat_region24
seq15	LTRharvest	target_site_duplication	856550	856554	.	?	.	Parent=repeat_region24
###
seq2	LTRharvest	repeat_region	84414	90385	.	?	.	ID=repeat_region25
seq2	LTRharvest	target_site_duplication	84414	84418	.	?	.	Parent=repeat_region25
seq2	LTRharvest	inverted_repeat	84419	84420	.	?	.	Parent=repeat_region25
seq2	LTRharvest	LTR_retrotransposon	84419	90380	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon25;Parent=repeat_region25
seq2	LTRharvest	long_terminal_repeat	84419	84750	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon25
seq2	LTRharvest	long_terminal_repeat	90049	90380	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon25
seq2	LTRharvest	inverted_repeat	84749	84750	.	?	.	Parent=repeat_region25
seq2	LTRharvest	inverted_repeat	90049	90050	.	?	.	Parent=repeat_region25
seq2	LTRharvest	inverted_repeat	90379	90380	.	?	.	Parent=repeat_region25
seq2	LTRharvest	target_site_duplication	90381	90385	.	?	.	Parent=repeat_region25
###
seq3	LTRharvest	repeat_region	513723	519691	.	?	.	ID=repeat_region26
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	513723	513727	.	?	.	Parent=repeat_region26
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	513728	513729	.	?	.	Parent=repeat_region26
seq3	LTRharvest	LTR_retrotransposon	513728	519686	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon26;Parent=repeat_region26
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	513728	514059	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon26
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	519366	519686	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon26
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	514058	514059	.	?	.	Parent=repeat_region26
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	519366	519367	.	?	.	Parent=repeat_region26
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	519685	519686	.	?	.	Parent=repeat_region26
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	519687	519691	.	?	.	Parent=repeat_region26
###
seq3	LTRharvest	repeat_region	645535	651462	.	?	.	ID=repeat_region27
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	645535	645539	.	?	.	Parent=repeat_region27
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	645540	645541	.	?	.	Parent=repeat_region27
seq3	LTRharvest	LTR_retrotransposon	645540	651457	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon27;Parent=repeat_region27
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	645540	645873	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon27
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	651124	651457	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon27
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	645872	645873	.	?	.	Parent=repeat_region27
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	651124	651125	.	?	.	Parent=repeat_region27
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	651456	651457	.	?	.	Parent=repeat_region27
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	651458	651462	.	?	.	Parent=repeat_region27
###
seq3	LTRharvest	repeat_region	871853	877821	.	?	.	ID=repeat_region28
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	871853	871857	.	?	.	Parent=repeat_region28
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	871858	871859	.	?	.	Parent=repeat_region28
seq3	LTRharvest	LTR_retrotransposon	871858	877816	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon28;Parent=repeat_region28
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	871858	872189	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon28
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	877476	877816	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon28
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	872188	872189	.	?	.	Parent=repeat_region28
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	877476	877477	.	?	.	Parent=repeat_region28
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	877815	877816	.	?	.	Parent=repeat_region28
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	877817	877821	.	?	.	Parent=repeat_region28
###
seq3	LTRharvest	repeat_region	878335	884262	.	?	.	ID=repeat_region29
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	878335	878339	.	?	.	Parent=repeat_region29
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	878340	878341	.	?	.	Parent=repeat_region29
seq3	LTRharvest	LTR_retrotransposon	878340	884257	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon29;Parent=repeat_region29
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	878340	878673	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon29
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	883924	884257	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon29
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	878672	878673	.	?	.	Parent=repeat_region29
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	883924	883925	.	?	.	Parent=repeat_region29
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	884256	884257	.	?	.	Parent=repeat_region29
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	884258	884262	.	?	.	Parent=repeat_region29
###
seq3	LTRharvest	repeat_region	981202	987170	.	?	.	ID=repeat_region30
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	981202	981206	.	?	.	Parent=repeat_region30
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	981207	981208	.	?	.	Parent=repeat_region30
seq3	LTRharvest	LTR_retrotransposon	981207	987165	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon30;Parent=repeat_region30
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	981207	981538	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon30
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	986834	987165	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon30
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	981537	981538	.	?	.	Parent=repeat_region30
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	986834	986835	.	?	.	Parent=repeat_region30
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	987164	987165	.	?	.	Parent=repeat_region30
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	987166	987170	.	?	.	Parent=repeat_region30
###
seq3	LTRharvest	repeat_region	987181	992683	.	?	.	ID=repeat_region31
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	987181	987185	.	?	.	Parent=repeat_region31
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	987186	987187	.	?	.	Parent=repeat_region31
seq3	LTRharvest	LTR_retrotransposon	987186	992678	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon31;Parent=repeat_region31
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	987186	987519	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon31
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	992345	992678	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon31
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	987518	987519	.	?	.	Parent=repeat_region31
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	992345	992346	.	?	.	Parent=repeat_region31
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	992677	992678	.	?	.	Parent=repeat_region31
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	992679	992683	.	?	.	Parent=repeat_region31
###
seq3	LTRharvest	repeat_region	1095799	1101734	.	?	.	ID=repeat_region32
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	1095799	1095803	.	?	.	Parent=repeat_region32
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	1095804	1095805	.	?	.	Parent=repeat_region32
seq3	LTRharvest	LTR_retrotransposon	1095804	1101729	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon32;Parent=repeat_region32
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	1095804	1096141	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon32
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	1101392	1101729	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon32
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	1096140	1096141	.	?	.	Parent=repeat_region32
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	1101392	1101393	.	?	.	Parent=repeat_region32
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	1101728	1101729	.	?	.	Parent=repeat_region32
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	1101730	1101734	.	?	.	Parent=repeat_region32
###
seq3	LTRharvest	repeat_region	1206733	1212660	.	?	.	ID=repeat_region33
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	1206733	1206737	.	?	.	Parent=repeat_region33
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	1206738	1206739	.	?	.	Parent=repeat_region33
seq3	LTRharvest	LTR_retrotransposon	1206738	1212655	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon33;Parent=repeat_region33
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	1206738	1207071	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon33
seq3	LTRharvest	long_terminal_repeat	1212322	1212655	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon33
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seq3	LTRharvest	inverted_repeat	1212322	1212323	.	?	.	Parent=repeat_region33
seq3	LTRharvest	inverted_repeat	1212654	1212655	.	?	.	Parent=repeat_region33
seq3	LTRharvest	target_site_duplication	1212656	1212660	.	?	.	Parent=repeat_region33
###
seq4	LTRharvest	repeat_region	443389	449322	.	?	.	ID=repeat_region34
seq4	LTRharvest	target_site_duplication	443389	443393	.	?	.	Parent=repeat_region34
seq4	LTRharvest	inverted_repeat	443394	443395	.	?	.	Parent=repeat_region34
seq4	LTRharvest	LTR_retrotransposon	443394	449317	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon34;Parent=repeat_region34
seq4	LTRharvest	long_terminal_repeat	443394	443735	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon34
seq4	LTRharvest	long_terminal_repeat	448981	449317	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon34
seq4	LTRharvest	inverted_repeat	443734	443735	.	?	.	Parent=repeat_region34
seq4	LTRharvest	inverted_repeat	448981	448982	.	?	.	Parent=repeat_region34
seq4	LTRharvest	inverted_repeat	449316	449317	.	?	.	Parent=repeat_region34
seq4	LTRharvest	target_site_duplication	449318	449322	.	?	.	Parent=repeat_region34
###
seq5	LTRharvest	repeat_region	137902	143870	.	?	.	ID=repeat_region35
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seq5	LTRharvest	long_terminal_repeat	143534	143865	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon35
seq5	LTRharvest	inverted_repeat	138237	138238	.	?	.	Parent=repeat_region35
seq5	LTRharvest	inverted_repeat	143534	143535	.	?	.	Parent=repeat_region35
seq5	LTRharvest	inverted_repeat	143864	143865	.	?	.	Parent=repeat_region35
seq5	LTRharvest	target_site_duplication	143866	143870	.	?	.	Parent=repeat_region35
###
seq6	LTRharvest	repeat_region	535749	541684	.	?	.	ID=repeat_region36
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seq6	LTRharvest	LTR_retrotransposon	535754	541679	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon36;Parent=repeat_region36
seq6	LTRharvest	long_terminal_repeat	535754	536091	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon36
seq6	LTRharvest	long_terminal_repeat	541342	541679	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon36
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	536090	536091	.	?	.	Parent=repeat_region36
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	541342	541343	.	?	.	Parent=repeat_region36
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	541678	541679	.	?	.	Parent=repeat_region36
seq6	LTRharvest	target_site_duplication	541680	541684	.	?	.	Parent=repeat_region36
###
seq6	LTRharvest	repeat_region	561832	567759	.	?	.	ID=repeat_region37
seq6	LTRharvest	target_site_duplication	561832	561836	.	?	.	Parent=repeat_region37
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seq6	LTRharvest	long_terminal_repeat	561837	562170	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon37
seq6	LTRharvest	long_terminal_repeat	567421	567754	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon37
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	562169	562170	.	?	.	Parent=repeat_region37
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	567421	567422	.	?	.	Parent=repeat_region37
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	567753	567754	.	?	.	Parent=repeat_region37
seq6	LTRharvest	target_site_duplication	567755	567759	.	?	.	Parent=repeat_region37
###
seq6	LTRharvest	repeat_region	568730	574699	.	?	.	ID=repeat_region38
seq6	LTRharvest	target_site_duplication	568730	568734	.	?	.	Parent=repeat_region38
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seq6	LTRharvest	long_terminal_repeat	568735	569066	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon38
seq6	LTRharvest	long_terminal_repeat	574363	574694	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon38
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	569065	569066	.	?	.	Parent=repeat_region38
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	574363	574364	.	?	.	Parent=repeat_region38
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	574693	574694	.	?	.	Parent=repeat_region38
seq6	LTRharvest	target_site_duplication	574695	574699	.	?	.	Parent=repeat_region38
###
seq6	LTRharvest	repeat_region	707184	712544	.	?	.	ID=repeat_region39
seq6	LTRharvest	target_site_duplication	707184	707188	.	?	.	Parent=repeat_region39
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seq6	LTRharvest	LTR_retrotransposon	707189	712539	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon39;Parent=repeat_region39
seq6	LTRharvest	long_terminal_repeat	707189	707528	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon39
seq6	LTRharvest	long_terminal_repeat	712200	712539	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon39
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	707527	707528	.	?	.	Parent=repeat_region39
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	712200	712201	.	?	.	Parent=repeat_region39
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	712538	712539	.	?	.	Parent=repeat_region39
seq6	LTRharvest	target_site_duplication	712540	712544	.	?	.	Parent=repeat_region39
###
seq6	LTRharvest	repeat_region	817382	823305	.	?	.	ID=repeat_region40
seq6	LTRharvest	target_site_duplication	817382	817386	.	?	.	Parent=repeat_region40
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	817387	817388	.	?	.	Parent=repeat_region40
seq6	LTRharvest	LTR_retrotransposon	817387	823300	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon40;Parent=repeat_region40
seq6	LTRharvest	long_terminal_repeat	817387	817718	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon40
seq6	LTRharvest	long_terminal_repeat	822969	823300	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon40
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seq6	LTRharvest	inverted_repeat	822969	822970	.	?	.	Parent=repeat_region40
seq6	LTRharvest	inverted_repeat	823299	823300	.	?	.	Parent=repeat_region40
seq6	LTRharvest	target_site_duplication	823301	823305	.	?	.	Parent=repeat_region40
###
seq7	LTRharvest	repeat_region	85529	91761	.	?	.	ID=repeat_region41
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seq7	LTRharvest	LTR_retrotransposon	85534	91756	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon41;Parent=repeat_region41
seq7	LTRharvest	long_terminal_repeat	85534	85904	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon41
seq7	LTRharvest	long_terminal_repeat	91386	91756	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon41
seq7	LTRharvest	inverted_repeat	85903	85904	.	?	.	Parent=repeat_region41
seq7	LTRharvest	inverted_repeat	91386	91387	.	?	.	Parent=repeat_region41
seq7	LTRharvest	inverted_repeat	91755	91756	.	?	.	Parent=repeat_region41
seq7	LTRharvest	target_site_duplication	91757	91761	.	?	.	Parent=repeat_region41
###
seq7	LTRharvest	repeat_region	543600	549637	.	?	.	ID=repeat_region42
seq7	LTRharvest	target_site_duplication	543600	543604	.	?	.	Parent=repeat_region42
seq7	LTRharvest	inverted_repeat	543605	543606	.	?	.	Parent=repeat_region42
seq7	LTRharvest	LTR_retrotransposon	543605	549632	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon42;Parent=repeat_region42
seq7	LTRharvest	long_terminal_repeat	543605	543936	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon42
seq7	LTRharvest	long_terminal_repeat	549301	549632	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon42
seq7	LTRharvest	inverted_repeat	543935	543936	.	?	.	Parent=repeat_region42
seq7	LTRharvest	inverted_repeat	549301	549302	.	?	.	Parent=repeat_region42
seq7	LTRharvest	inverted_repeat	549631	549632	.	?	.	Parent=repeat_region42
seq7	LTRharvest	target_site_duplication	549633	549637	.	?	.	Parent=repeat_region42
###
seq8	LTRharvest	repeat_region	205212	210649	.	?	.	ID=repeat_region43
seq8	LTRharvest	target_site_duplication	205212	205216	.	?	.	Parent=repeat_region43
seq8	LTRharvest	inverted_repeat	205217	205218	.	?	.	Parent=repeat_region43
seq8	LTRharvest	LTR_retrotransposon	205217	210644	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon43;Parent=repeat_region43
seq8	LTRharvest	long_terminal_repeat	205217	205556	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon43
seq8	LTRharvest	long_terminal_repeat	210305	210644	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon43
seq8	LTRharvest	inverted_repeat	205555	205556	.	?	.	Parent=repeat_region43
seq8	LTRharvest	inverted_repeat	210305	210306	.	?	.	Parent=repeat_region43
seq8	LTRharvest	inverted_repeat	210643	210644	.	?	.	Parent=repeat_region43
seq8	LTRharvest	target_site_duplication	210645	210649	.	?	.	Parent=repeat_region43
###
seq9	LTRharvest	repeat_region	197239	203474	.	?	.	ID=repeat_region44
seq9	LTRharvest	target_site_duplication	197239	197243	.	?	.	Parent=repeat_region44
seq9	LTRharvest	inverted_repeat	197244	197245	.	?	.	Parent=repeat_region44
seq9	LTRharvest	LTR_retrotransposon	197244	203469	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon44;Parent=repeat_region44
seq9	LTRharvest	long_terminal_repeat	197244	197614	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon44
seq9	LTRharvest	long_terminal_repeat	203099	203469	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon44
seq9	LTRharvest	inverted_repeat	197613	197614	.	?	.	Parent=repeat_region44
seq9	LTRharvest	inverted_repeat	203099	203100	.	?	.	Parent=repeat_region44
seq9	LTRharvest	inverted_repeat	203468	203469	.	?	.	Parent=repeat_region44
seq9	LTRharvest	target_site_duplication	203470	203474	.	?	.	Parent=repeat_region44
###
seq9	LTRharvest	repeat_region	472146	483665	.	?	.	ID=repeat_region45
seq9	LTRharvest	target_site_duplication	472146	472150	.	?	.	Parent=repeat_region45
seq9	LTRharvest	inverted_repeat	472151	472152	.	?	.	Parent=repeat_region45
seq9	LTRharvest	LTR_retrotransposon	472151	483660	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon45;Parent=repeat_region45
seq9	LTRharvest	long_terminal_repeat	472151	472488	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon45
seq9	LTRharvest	long_terminal_repeat	483323	483660	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon45
seq9	LTRharvest	inverted_repeat	472487	472488	.	?	.	Parent=repeat_region45
seq9	LTRharvest	inverted_repeat	483323	483324	.	?	.	Parent=repeat_region45
seq9	LTRharvest	inverted_repeat	483659	483660	.	?	.	Parent=repeat_region45
seq9	LTRharvest	target_site_duplication	483661	483665	.	?	.	Parent=repeat_region45
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