Codebase list genometools / HEAD testdata / see-ext-at1MB-400-dtrace.matches
HEAD

Tree @HEAD (Download .tar.gz)

see-ext-at1MB-400-dtrace.matches @HEADraw · history · blame

# Options: -ii at1MB -l 400 -outfmt trace=50 -minidentity 80 -history 60
# Fields: s. len, s. seqnum, s. start, strand, q. len, q. seqnum, q. start, score, editdist, % identity, trace
597 1 0 F 592 4 7 898 97 83.68 0,0,0,-3,0,0,0,0,0,1,1,9
538 1 9 F 523 47 0 779 94 82.28 0,0,-1,-2,0,0,-2,2,5,8,17
577 2 72 F 606 3 0 916 89 84.95 0,0,0,0,0,0,0,0,-3,-9,-10,16
626 2 34 F 656 5 0 1063 73 88.61 0,0,0,0,0,0,0,0,0,-4,-8,-10,16
484 2 176 F 513 6 104 730 89 82.15 -1,0,0,0,0,0,-4,-7,-9,8
706 2 0 F 749 16 84 1269 62 91.48 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,-6,-8,-13,-16,44
660 2 0 F 687 39 0 1065 94 86.04 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,-6,-8,-12,39
668 3 0 F 660 5 38 1139 63 90.51 0,0,0,0,0,0,0,0,0,1,1,1,2,35
639 3 14 F 631 6 14 1063 69 89.13 0,0,-1,0,0,0,0,0,1,1,0,4,14
655 3 0 F 650 16 156 1047 86 86.82 0,0,0,0,0,0,0,0,0,1,1,1,2,45
653 3 0 F 643 39 72 1203 31 95.22 0,0,0,0,0,0,0,0,0,1,1,1,7,47
613 4 16 F 571 47 0 1022 54 90.88 0,0,0,0,0,0,0,0,4,6,15,12,42
704 5 52 F 700 6 14 1056 116 83.48 0,0,-1,0,0,0,0,0,0,0,-1,0,5,2,45
742 5 0 F 746 16 118 1323 55 92.61 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,-1,5
756 5 0 F 750 39 34 1275 77 89.77 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,5,2,43
599 6 104 F 601 16 260 915 95 84.17 1,0,0,0,0,0,0,0,1,0,-4,1
783 6 14 F 788 39 86 1400 57 92.74 0,0,1,0,0,0,0,0,0,0,1,0,0,0,-1,11
467 11 135 F 449 29 138 766 50 89.08 2,0,0,0,0,0,0,5,8,36
767 16 84 F 766 39 0 1248 95 87.61 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,1,3,30
397 18 0 F 417 46 194 634 60 85.26 0,0,0,0,0,-2,-8,-7
458 34 157 F 442 1317 0 789 37 91.78 9,4,1,0,0,0,0,2,0,42
399 35 140 F 402 72 145 717 28 93.01 -6,0,0,0,0,0,1,3
430 61 134 F 438 65 137 787 27 93.78 0,0,0,0,1,0,0,-1,12
517 64 0 F 517 65 0 1034 0 100.00 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,33
461 78 86 F 459 80 149 800 40 91.30 2,0,0,0,1,0,2,-3,0,39
542 78 223 F 540 1488 8 995 29 94.64 0,1,1,0,0,0,0,0,0,0,8
568 79 56 F 568 1495 0 1022 38 93.31 3,-1,-2,0,0,0,0,0,0,0,0,32
417 223 0 F 414 271 2 801 10 97.59 2,0,0,0,0,0,0,1,33
418 229 0 F 419 270 0 828 3 99.28 0,0,0,0,0,0,0,0,31
418 318 13 F 428 1693 142 621 75 82.27 -5,0,2,0,-7,-8,-2,6,36
405 336 36 F 419 1703 0 734 30 92.72 -1,0,0,0,0,0,-6,-7,45
439 376 0 F 450 1694 81 703 62 86.05 -7,-2,-3,0,0,-1,-1,0,14
400 380 1 F 408 451 26 766 14 96.53 -7,-1,0,0,0,0,0,0
403 380 0 F 406 630 10 722 29 92.83 -1,-2,0,0,0,0,0,0,47
401 380 0 F 404 736 106 784 7 98.26 -3,0,0,0,0,0,0,0,49
400 380 3 F 403 846 215 773 10 97.51 -3,0,0,0,0,0,0,0
403 380 0 F 407 902 16 783 9 97.78 -4,0,0,0,0,0,0,0,47
401 380 2 F 408 1100 35 740 23 94.31 -5,-2,0,0,0,0,0,0,49
401 380 2 F 407 1143 2 721 29 92.82 -2,-3,-1,0,0,0,0,0,49
403 380 0 F 407 1151 49 786 8 98.02 -4,0,0,0,0,0,0,0,47
403 380 0 F 409 1230 104 773 13 96.80 -3,-2,-1,0,0,0,0,0,47
399 380 0 F 406 1360 9 730 25 93.79 -6,-1,0,0,0,0,0,1
475 404 165 F 466 819 35 809 44 90.65 8,3,-1,-1,0,0,0,0,0,25
418 404 186 F 420 975 52 760 26 93.79 0,0,-1,-1,0,0,0,0,32
420 404 213 F 444 1362 2 699 55 87.27 -7,-5,-9,-3,0,0,0,0,30
453 404 187 F 455 1500 29 806 34 92.51 0,1,-2,-1,0,0,0,0,0,47
434 406 8 F 430 542 0 771 31 92.82 4,0,0,0,0,0,0,0,16
402 406 40 F 413 1056 0 713 34 91.66 -1,-6,-4,0,0,0,0,0,48
430 412 83 F 436 1525 0 755 37 91.45 -6,-3,2,1,0,0,0,0,20
434 426 27 F 429 795 0 722 47 89.11 3,3,1,-1,-1,0,0,0,16
409 432 9 F 410 652 0 735 28 93.16 2,-3,0,0,0,0,0,0,41
422 432 0 F 423 825 61 791 18 95.74 0,-1,0,0,0,0,0,0,28
397 432 0 F 403 1469 51 728 24 94.00 -5,-3,2,0,0,0,0,3
423 449 0 F 421 868 143 802 14 96.68 2,-1,1,0,0,0,0,0,27
434 451 0 F 427 736 83 825 12 97.21 4,3,0,0,0,0,0,0,16
434 451 0 F 427 846 189 816 15 96.52 4,3,0,0,0,0,0,0,16
424 451 10 F 420 902 1 787 19 95.50 2,2,0,0,0,0,0,0,26
434 451 0 F 429 1100 12 764 33 92.35 6,-1,0,0,0,0,0,0,16
434 451 0 F 428 1151 26 823 13 96.98 4,2,0,0,0,0,0,0,16
434 451 0 F 431 1230 80 805 20 95.38 3,3,-3,0,0,0,0,0,16
417 451 15 F 414 1360 1 726 35 91.58 1,2,0,0,0,0,0,0,33
415 452 0 F 413 882 3 750 26 93.72 0,1,2,-1,0,0,0,0,35
424 454 70 F 432 1837 0 793 21 95.09 1,0,0,0,0,0,-1,-4,22
453 460 27 F 452 1351 0 821 28 93.81 0,-1,0,2,0,0,0,0,0,47
492 474 48 F 480 543 0 903 23 95.27 7,4,0,1,0,0,0,0,0,8
540 474 0 F 522 658 80 975 29 94.54 5,5,4,1,2,1,0,0,0,0,10
454 474 86 F 440 713 0 786 36 91.95 8,4,2,0,0,0,0,0,0,46
423 474 0 F 408 736 18 693 46 88.93 6,3,1,0,1,0,0,2,29
435 474 105 F 433 798 0 811 19 95.62 2,0,1,-1,0,0,0,0,15
480 474 35 F 479 826 2 914 15 96.87 0,-1,1,1,0,0,0,0,0,20
423 474 0 F 418 846 114 685 52 87.63 -4,2,2,0,1,0,0,2,29
422 474 118 F 417 849 0 758 27 93.56 1,3,0,0,0,1,0,0,28
488 474 47 F 483 912 0 932 13 97.32 3,1,1,0,0,0,0,0,0,12
407 474 57 F 407 988 0 664 50 87.71 1,-2,1,1,0,0,0,0,42
419 474 45 F 417 1049 0 722 38 90.91 1,2,-1,1,0,0,0,1,29
453 474 87 F 444 1120 0 798 33 92.64 5,1,2,0,0,1,0,0,0,47
422 474 1 F 425 1230 2 679 56 86.78 -4,-2,1,-2,0,0,0,2,30
500 474 40 F 475 1297 0 852 41 91.59 11,8,3,3,0,0,0,0,0,0
447 474 68 F 436 1327 0 775 36 91.85 7,2,2,0,0,0,0,0,3
409 480 46 F 398 926 0 744 21 94.80 7,4,0,0,0,0,0,0,41
425 489 0 F 429 1339 12 806 16 96.25 -3,-2,1,0,0,0,0,0,25
409 522 41 F 410 1134 0 723 32 92.19 -1,0,0,0,0,0,0,0,41
406 530 14 F 398 1343 30 735 23 94.28 6,2,0,0,0,0,0,0,44
422 536 58 F 414 1082 12 755 27 93.54 5,3,0,0,0,0,0,0,28
400 542 30 F 413 1056 0 738 25 93.85 -6,-3,-4,0,0,0,0,0
477 543 3 F 476 658 126 890 21 95.59 -3,1,2,0,1,0,0,0,0,23
436 543 44 F 429 713 11 793 24 94.45 5,0,2,0,0,0,0,0,14
429 543 51 F 430 798 3 793 22 94.88 -1,1,0,-1,0,0,0,0,21
455 543 0 F 466 826 15 852 23 95.01 -10,-1,0,0,0,0,0,0,0,45
419 543 61 F 416 849 1 748 29 93.05 1,1,0,0,0,1,0,0,31
475 543 0 F 482 912 1 897 20 95.82 -6,-1,1,-1,0,0,0,0,0,25
397 543 7 F 407 988 0 633 57 85.82 -6,-3,0,0,0,0,0,2
404 543 0 F 414 1049 3 677 47 88.51 -7,-1,-1,0,0,0,1,-2,46
447 543 33 F 444 1120 0 798 31 93.04 0,1,1,0,0,1,0,0,3
480 543 0 F 468 1297 7 855 31 93.46 6,2,3,1,0,0,0,0,0,20
439 543 16 F 436 1327 0 782 31 92.91 1,2,0,0,0,0,0,0,11
436 549 0 F 448 661 68 773 37 91.63 -6,-2,0,-1,-1,-1,0,-1,14
402 568 10 F 406 1793 2 739 23 94.31 -1,-1,0,0,0,0,-1,-1,48
432 584 48 F 449 1661 0 707 58 86.83 -4,-3,0,0,0,0,-1,-5,14
412 630 2 F 414 736 96 730 32 92.25 -3,0,1,0,0,0,0,0,38
415 630 1 F 416 846 202 729 34 91.82 -2,0,1,0,0,0,0,0,35
415 630 1 F 419 902 4 732 34 91.85 -5,0,1,0,0,0,0,0,35
416 630 0 F 420 1100 23 719 39 90.67 -2,-3,1,0,0,0,0,0,34
425 630 9 F 426 1143 1 728 41 90.36 2,-2,-1,0,0,0,0,0,25
415 630 1 F 418 1151 38 737 32 92.32 -4,0,1,0,0,0,0,0,35
416 630 0 F 421 1230 92 732 35 91.64 -3,-1,-1,0,0,0,0,0,34
409 630 3 F 414 1360 1 688 45 89.06 -5,-1,1,0,0,0,0,0,41
400 652 10 F 401 825 79 711 30 92.51 -2,1,0,0,0,0,0,0
412 654 1 F 407 807 63 711 36 91.21 4,-2,1,1,1,0,0,0,38
440 654 1 F 432 866 142 719 51 88.30 2,1,2,2,1,0,0,0,10
461 654 0 F 461 1212 120 799 41 91.11 -2,-1,1,1,1,0,0,0,0,39
441 658 161 F 438 713 2 777 34 92.26 3,0,1,-1,0,0,0,0,9
425 658 60 F 426 736 0 683 56 86.84 4,-2,-4,-1,-1,-1,0,1,28
428 658 174 F 433 798 0 795 22 94.89 -1,-2,0,-2,0,0,0,0,22
467 658 110 F 481 826 0 867 27 94.30 -7,-4,-1,-1,-1,0,0,0,0,33
465 658 20 F 485 846 47 737 71 85.05 -4,-11,-4,-2,-2,0,-1,0,0,39
416 658 186 F 416 849 1 763 23 94.47 -1,1,0,-1,1,0,0,0,34
471 658 126 F 479 912 4 896 18 96.21 -3,-2,-2,0,-1,0,0,0,0,29
395 658 131 F 407 988 0 646 52 87.03 -5,-4,-1,0,-1,0,0,4
395 658 131 F 405 1049 12 677 41 89.75 -4,-2,-2,0,-1,0,0,4
444 658 158 F 444 1120 0 786 34 92.34 0,0,0,-1,0,1,0,0,6
397 658 88 F 416 1230 11 624 63 84.50 -10,-7,-1,-4,0,-1,0,7
486 658 116 F 475 1297 0 853 36 92.51 7,3,2,0,-1,0,0,0,0,14
437 658 140 F 436 1327 0 777 32 92.67 2,1,-1,-1,0,0,0,0,13
415 691 0 F 433 814 49 722 42 90.09 -13,-5,0,0,0,0,0,0,35
421 695 59 F 427 938 0 761 29 93.16 -1,-3,-3,0,1,0,0,0,29
432 701 5 F 422 715 7 731 41 90.40 7,4,-1,0,0,0,0,0,18
423 713 17 F 432 798 1 753 34 92.05 -7,-1,0,-1,0,0,0,0,27
415 713 0 F 428 826 53 729 38 90.98 -10,-1,-2,0,0,0,0,0,35
413 713 27 F 417 849 0 710 40 90.36 -6,1,0,0,1,0,0,0,37
435 713 0 F 446 912 37 782 33 92.51 -8,0,-3,0,0,0,0,0,15
437 713 3 F 442 1120 2 789 30 93.17 -5,0,-1,0,0,1,0,0,13
437 713 3 F 437 1297 38 769 35 91.99 -1,2,-1,0,0,0,0,0,13
414 713 1 F 420 1327 16 723 37 91.13 -5,1,-2,0,0,0,0,0,36
382 724 29 F 433 1826 2 605 70 82.82 -17,-9,-1,0,0,-6,-11,11
510 736 0 F 525 846 91 915 40 92.27 -14,-2,1,0,0,0,0,0,0,0,40
414 736 96 F 416 902 5 800 10 97.59 -2,0,0,0,0,0,0,0,36
435 736 75 F 437 1100 4 782 30 93.12 2,-4,0,0,0,0,0,0,15
406 736 104 F 407 1143 0 726 29 92.87 4,-4,-1,0,0,0,0,0,44
452 736 58 F 454 1151 0 876 10 97.79 -1,-1,0,0,0,0,0,0,0,48
485 736 25 F 500 1230 11 898 29 94.11 -10,-2,0,-3,0,0,0,0,0,15
411 736 97 F 414 1360 1 747 26 93.70 -2,-1,0,0,0,0,0,0,39
408 798 0 F 407 826 74 755 20 95.09 0,0,0,1,0,0,0,0,42
420 798 13 F 417 849 0 723 38 90.92 -1,2,0,1,0,1,0,0,30
428 798 0 F 428 912 55 796 20 95.33 -1,1,-1,1,0,0,0,0,22
432 798 1 F 428 1120 16 752 36 91.63 0,2,0,1,0,1,0,0,18
430 798 3 F 423 1297 52 766 29 93.20 3,2,1,1,0,0,0,0,20
405 798 3 F 402 1327 34 714 31 92.32 1,1,0,1,0,0,0,0,45
468 807 2 F 464 866 82 800 44 90.56 0,-1,3,0,2,0,0,0,0,32
468 807 2 F 476 1212 57 824 40 91.53 -3,-5,0,0,0,0,0,0,0,32
445 815 0 F 462 1699 0 778 43 90.52 -1,-2,-1,0,0,-1,-1,-8,2
451 819 14 F 467 975 5 810 36 92.16 -9,-6,-1,0,0,0,0,0,0,49
418 819 76 F 443 1362 3 726 45 89.55 -10,-5,-7,-3,0,0,0,0,32
484 819 35 F 494 1500 8 882 32 93.46 -6,-3,-1,0,0,0,0,0,0,16
432 825 27 F 441 1469 13 765 36 91.75 -6,-5,2,0,0,0,0,0,18
467 826 14 F 463 912 0 873 19 95.91 5,-1,1,-1,0,0,0,0,0,33
409 826 12 F 407 1049 0 702 38 90.69 2,1,-1,0,0,0,0,1,40
426 826 55 F 419 1120 0 743 34 91.95 4,1,1,0,0,1,0,0,24
474 826 7 F 450 1297 0 801 41 91.13 12,7,3,2,0,0,0,0,0,26
446 826 35 F 436 1327 0 774 36 91.84 8,1,1,0,0,0,0,0,4
419 846 199 F 422 902 1 793 16 96.20 -3,0,0,0,0,0,0,0,31
434 846 184 F 437 1100 6 772 33 92.42 1,-4,0,0,0,0,0,0,16
454 846 164 F 456 1151 0 859 17 96.26 0,-2,0,0,0,0,0,0,0,46
503 846 115 F 511 1230 2 879 45 91.12 1,-5,-1,-2,-1,0,0,0,0,0,47
410 846 204 F 414 1360 1 731 31 92.48 -3,-1,0,0,0,0,0,0,40
447 848 138 F 476 1658 0 737 62 86.57 -4,-1,-1,-2,-1,0,-1,-8,-8
412 849 0 F 415 912 68 746 27 93.47 1,-3,0,0,0,-1,0,0,38
417 849 0 F 417 1120 27 705 43 89.69 1,-1,0,0,1,-1,0,0,33
417 849 0 F 413 1297 62 722 36 91.33 4,0,1,0,0,-1,0,0,33
557 866 17 F 561 1212 0 884 78 86.05 6,-1,-2,-4,-1,-2,0,0,0,0,0,43
405 867 233 F 417 1602 0 708 38 90.75 -2,-1,0,0,0,0,-2,-6,44
421 884 0 F 427 890 8 770 26 93.87 -3,-1,-2,0,0,0,0,0,29
424 892 0 F 420 1300 64 772 24 94.31 2,2,0,0,0,0,0,0,26
423 902 0 F 423 1100 20 747 33 92.20 3,-3,0,0,0,0,0,0,27
409 902 14 F 409 1143 0 728 30 92.67 5,-4,-1,0,0,0,0,0,41
423 902 0 F 422 1151 34 818 9 97.87 1,0,0,0,0,0,0,0,27
420 902 3 F 422 1230 91 785 19 95.49 0,1,-3,0,0,0,0,0,30
404 902 15 F 407 1360 8 736 25 93.83 -2,-1,0,0,0,0,0,0,46
438 905 0 F 451 1693 83 730 53 88.08 0,1,1,0,-1,-5,-9,-1,13
403 912 9 F 407 988 0 648 54 86.67 -1,-3,1,0,0,0,1,-2,47
411 912 1 F 414 1049 3 696 43 89.58 -2,1,-2,1,0,0,0,0,38
445 912 38 F 439 1120 0 791 31 92.99 3,0,2,0,0,1,0,0,5
483 912 0 F 464 1297 6 842 35 92.61 10,5,2,2,0,0,0,0,0,17
444 912 19 F 436 1327 0 778 34 92.27 6,0,2,0,0,0,0,0,6
396 975 76 F 417 1362 0 687 42 89.67 -5,-4,-8,-4,0,0,0,4
419 975 53 F 419 1500 29 781 19 95.47 0,1,-1,0,0,0,0,0,31
426 988 0 F 424 1049 12 766 28 93.41 0,4,-2,0,0,0,0,0,24
433 1049 0 F 413 1297 4 630 72 82.98 10,6,4,1,0,0,0,-1,17
409 1049 24 F 401 1327 2 615 65 83.95 6,2,1,0,0,0,-1,4,37
409 1097 23 F 417 1806 1 721 35 91.53 -4,-1,0,1,0,0,-2,-2,41
410 1100 33 F 408 1143 1 725 31 92.42 5,-2,-1,0,0,0,0,0,40
442 1100 1 F 440 1151 16 789 31 92.97 0,1,1,0,0,0,0,0,8
440 1100 3 F 442 1230 71 792 30 93.20 -3,3,-2,0,0,0,0,0,10
413 1100 26 F 414 1360 1 704 41 90.08 -3,2,0,0,0,0,0,0,37
444 1120 0 F 439 1297 36 772 37 91.62 3,2,1,0,0,-1,0,0,6
419 1120 0 F 419 1327 17 715 41 90.21 1,1,-1,0,0,-1,0,0,31
409 1143 0 F 409 1151 47 734 28 93.15 -4,3,1,0,0,0,0,0,41
407 1143 2 F 407 1230 106 742 24 94.10 -1,2,-1,0,0,0,0,0,43
405 1143 0 F 405 1360 10 681 43 89.38 -3,2,1,0,0,0,0,0,45
456 1151 0 F 463 1230 50 844 25 94.56 -5,1,-1,-2,0,0,0,0,0,44
412 1151 40 F 414 1360 1 742 28 93.22 -1,-1,0,0,0,0,0,0,38
436 1210 50 F 431 1516 1 786 27 93.77 4,2,-1,0,0,0,0,0,14
443 1226 5 F 421 1296 26 732 44 89.81 11,8,2,1,0,0,0,0,7
414 1230 95 F 414 1360 1 735 31 92.51 -2,0,2,0,0,0,0,0,36
404 1268 97 F 411 1627 3 746 23 94.36 -3,-1,0,0,0,0,0,-2,45
395 1268 101 F 405 1747 0 713 29 92.75 -3,0,0,0,0,0,-3,1
451 1294 10 F 463 1786 0 740 58 87.31 -4,-5,-2,-1,0,0,-1,-1,2,49
429 1297 21 F 436 1327 0 754 37 91.45 -4,-1,-2,0,0,0,0,0,21
445 1362 1 F 425 1500 52 732 46 89.43 5,2,9,3,1,0,0,0,5
477 1620 0 F 478 1796 6 832 41 91.41 0,0,0,0,0,0,2,0,-4,24
446 1620 20 F 439 1937 0 762 41 90.73 0,0,0,0,0,1,2,2,6
403 1627 8 F 408 1747 0 754 19 95.31 0,0,0,0,0,0,-3,-2,47
415 1663 0 F 414 1893 27 700 43 89.63 0,0,0,0,1,-1,2,0,34
438 1696 0 F 439 1781 23 748 43 90.19 0,0,0,0,0,0,-1,-1,13
433 1745 0 F 427 1764 1 776 28 93.49 0,0,0,0,0,0,1,3,19
458 1745 0 F 455 1767 0 829 28 93.87 0,0,0,0,0,0,0,0,2,43
450 1745 9 F 443 1882 0 809 28 93.73 1,0,0,0,0,0,1,4,1
427 1764 1 F 432 1767 0 796 21 95.11 0,0,0,0,0,0,-1,-3,22
416 1764 10 F 415 1882 0 783 16 96.15 1,0,0,0,0,0,0,0,34
403 1764 7 F 417 1896 0 700 40 90.24 1,0,0,0,0,-1,-9,-4,46
446 1767 9 F 440 1882 0 826 20 95.49 1,0,0,0,0,0,2,2,5
405 1767 6 F 413 1896 0 710 36 91.20 1,0,0,0,0,-1,-8,0,45
494 1788 0 F 499 1850 9 882 37 92.55 0,0,0,0,0,0,0,1,-1,1
449 1796 26 F 439 1937 0 759 43 90.32 0,0,0,0,0,0,1,3,7
458 1802 3 F 471 1877 0 827 34 92.68 0,0,0,0,0,0,-2,-5,-5,41
435 1828 6 F 446 1947 0 734 49 88.88 0,0,0,0,0,0,-1,-6,11
399 1882 0 F 414 1896 3 705 36 91.14 0,0,0,0,0,-2,-8,-4
414 299 0 P 420 883 20 729 35 91.61 0,0,0,0,-2,-1,-4,0,37